Đền Tam Thánh thờ 3 vị: Đức Đinh Điền Khai Quốc Công Thần Tổng Quốc Chính Đại Vương; Kiều Mộc Thiền Sư Đại Tướng Quân Lương Tuấn; Thượng Trân Công Chúa hiệu tỷ Khiêu tăng. Chùa Yên Lữ thờ Phật cũng là nơi tưởng nhớ công đức thiền sư Lương Tuấn và Thượng Trân Công Chúa.
Đền Tam Thánh thờ phụng Kiều mộc thiền sư Lương Tuấn là người thân cận và có công lớn giúp Đinh Điền xây dựng căn cứ. Đức ông đã vận động quân dân lập 9 Đại bản doanh từ Yên Lữ, Yên Bạc quê ngoại của Đinh Điền đến các nơi như: Xuân Dương, Phú Mỹ, Yên Liêu, Bồ Vi và Chùa Tháp dẹp tan loạn 12 sứ quân. Kiều Mộc thiền sư còn là người thày dạy kinh cho Tượng Trân công chúa rồi đưa Thượng Trân Công Chúa về Trúc Lâm tu hành.
Vào đầu thế kỉ X, vua Ngô Quyền người anh hùng dân tộc, đã
lãnh đạo quân, dân đánh đuổi quân Nam Hán, giành lại giang sơn gấm vóc cho đất
nước Đại Việt ta. Năm 944, Ngô Quyền qua đời, đất nước lâm nguy.
Đứng trước hoàn cảnh đó (vua) Đinh Bộ Lĩnh người động Hoa
Lư, đã chiêu hiền đãi sỹ, nhiều người cùng chí hướng như: Đinh Điền, Nguyễn Bặc,
Lưu Cơ, Trịnh Tú…, đặc biệt một số nhà sư cũng nhiệt tình tham gia.
(Vua) Đinh Bộ Lĩnh đã xây dựng được một nghĩa binh khá mạnh,
đồng loạt tiến hành dẹp loạn 12 sứ quân. Đinh Điền là một tướng lĩnh có uy lực
được ông tin cậy, giao cho tổ chức chiến đấu trên địa bàn trọng yếu từ Vĩnh Phú
đến Hoa Lư ngày nay.
Kiều Mộc thiền sư Lương Tuấn người thân cận và có công lớn
giúp Đinh Điền xây dựng căn cứ. Vận động lập 9 đại bản doanh từ Yên Lữ, Yên Bạc
(quê ngoại của Đinh Điền) đến Xuân Dương, Phú Mỹ, Yên Liêu, Bồ Vi và Chùa Tháp.
Tổ chức đúc giáo, rèn gươm mua sắm vũ khí. Xây dựng lực lượng nghĩa binh. Nhờ vậy
đội quân của Đinh Điền, Kiều Mộc trở thành một.
Chiến thắng trở về Đinh Điền, Kiều Mộc góp phần cùng các tướng
lĩnh và nhà sư Ngô Chấn Lưu giúp (vua) Đinh Bộ Lĩnh lên ngôi Hoàng Đế lập nên
nước Đại Cồ Việt. Kiều Mộc thiền sư còn là người thày dạy kinh cho Thượng Trân
Công chúa rồi đưa Thượng Trân Công chúa về Trúc Lâm tu hành.
Đế triều Lý Thái Tổ Thuận Thiên thứ 5 (Giáp Dần), nhân dịp
xét thưởng công lao các tiết nghĩa chủ công thần, ông được truy phong Trúc Lâm
Kiều Mộc Thụy Giáo Thiền Sư Đại Tướng Quân Lương Tuấn. Nhà vua còn chỉ dụ cho
các nơi có đại bản doanh trước đây, lập đền thờ ông nhớ ơn những người có công
với nước.
Theo cuốn Đinh Tư Đồ Sự tích Hán nôm còn lưu giữ tại địa
phương. Chùa Yên Lữ và đền Tam Thánh được các bậc tiền nhân xây dựng vào năm Kỉ
Mùi (1019), hoàn thành năm Tân Dậu (1021). Chùa và đền được tọa lạc ngay trên
khu đất các vị thần được ban cấp bổng lộc, chính nơi đây cũng là đại bản danh
xưa. Đền thờ 3 vị: Đức Đinh Điền Khai Quốc Công Thần Tổng Quốc Chính Đại Vương;
Kiều Mộc Thiền Sư Đại Tướng Quân Lương Tuấn; Thượng Trân Công Chúa hiệu tỷ
Khiêu tăng. Chùa thờ Phật cũng là nơi tưởng nhớ công đức thiền sư Lương Tuấn và
Thượng Trân Công Chúa.
Đền Tam Thánh, thờ phụng Kiều Mộc Thiền sư Lương Tuấn
Trải qua trên 500 năm thăng trầm của lịch sử, đã qua nhiều lần
nâng cấp và tôn tạo cho đến thời hậu Lê (1578), các bậc tiền nhân mới xây dựng
to đẹp hơn, theo kiến truc lúc đương thời. Nhiều năm sau đó, đã có trùng tu
nhưng vẫn còn hạng mục như cột, xà, bẩy, long ngai, bài vị, long sàng được chạm
trổ long ly cổ kính vẫn còn giữ nguyên vẹn cho đến ngày nay.
Bên cạnh đền là ngôi chùa nằm phía Đông xây dựng kiểu chữ nhật
đứng, cửa ra vào theo kiểu Tam quan hai tầng, mái đao. Trong chùa còn một số mảng
chạm khắc thời nhà Mạc, trang trí theo kiểu rồng cuốn cổ phú hà mã đường truyện
lá dắt. Qua triều đại từ Lê Cảnh Hưng (1838) đến Khải Định (1917), các nhà vua
đã phong tới 19 đạo sắc còn lưu giữ tại đền.
Đền Tam Thánh và chùa Yên Lữ trong hai cuộc kháng chiến chống
thực dân Pháp và đế quốc Mỹ là cơ sở cho cán bộ, bộ đội đi về theo dõi hoạt động
của địch, nhằm chuẩn bị đánh bại các cuộc tấn công càn quét của chúng. Nơi đây,
cũng là nơi trú quân, chuẩn bị vũ khí nhằm đánh trả máy bay Mỹ trong chiến
tranh phá hoại. Và là nơi sơ tán của trường cấp 3B Yên Khánh (1968-1971).
Di tích lịch sử đền Tam thánh, Chùa Yên Lữ phụng sự các nhân
vật lịch sử có công với nước. Giá trị giáo dục về truyền thống yêu nước, thủy
chung của con người Việt Nam. Xuất phát từ giá trị đó. năm 1997, Bộ Văn hóa đã
quyết định xếp hạng và cấp bằng Lịch sử, văn hóa cấp Quốc gia cho đền Tam Thánh
và Chùa Yên Lữ.